日本樱美林大学教授佐藤考一认为，南海争端可分为“高烈度”、“中烈度”和“低烈度。”前者以2001年海南岛上空的中美撞机事件为代表，中间那种状况则是中国的相关岛礁建设和美国军舰进入中国相关岛礁的12海里范围。为了“制约”中国的这一做法，日本已分别向越南和菲律宾提供了巡逻船，海上自卫队还与相关国家开展了联合训练。“低烈度”争端中最麻烦的问题是中国船只与东南亚国家船只在海上发生冲突。据美国相关机构统计，在2010—2016年期间，一共发生过48起这类冲突，其中近8成与中国有关。欲解决这一问题，首先必须实现信息共享，例如日本与新加坡合作建立了海盗信息中心，应更多建立类似的中心。
日本立命馆大学特聘教授白石隆针对南海现状指出：“印太”这一地理名词非常重要，从太平洋经过马六甲海峡进入印度洋，这是一片广袤的海域，日美印澳在这一地区的战略合作极为重要，这可在相当程度上对冲中国的“一带一路”战略所具有的地缘政治学意义。目前南海问题中最受关注的是黄岩岛，眼下中菲关系之所以相对稳定，就是因为黄岩岛风平浪静。但一旦中国在该岛附近建设人工岛并让导弹和战斗机上岛，日本与美国以及印度和澳大利亚应如何应对，日本政府必须考虑这一问题。
同志社大学教授阪元茂树在发言中呼吁，中国完全视“南海仲裁”为一张废纸，今后将继续控制相关岛礁，从而使“南中国海”演变为“中国海”，日本应联手整个国际社会，在南海建立以法律为依据的秩序。
同志社大学南海研究中心主任浅野亮在会上指出：一旦中国的国力超越美国，中国会继续维护威斯特法利亚体制和尊重现有的价值观，还是仅追求本国的狭隘利益？无论是何种情况，如果今后中国的国力出现下降，无法维持通过“一带一路”战略所扩大的势力范围和基础设施体系，届时将会出现怎样的局面呢？这将是一个怎样的崩溃过程呢？
日本人一向不擅长思考长远和全局性问题，但在这一问题上却一反常态，在中国崛起方兴未艾之际，已经在考虑“中国崩溃”了。这与其说是一种基于逻辑推理做出的判断，不如说是日本人心态的反映，是一种强烈的主观愿望而已。
近年来日本为搅局南海问题使出了浑身解数，但由于日本的力量有限，因此其搅局的手段也相对有限，无非是向相关国家提供一些船只，与这些国家开展联合训练，声嘶力竭地叫嚷建立以法律为基础的南海秩序。它希望美国能不断加大巡航南海的力度，但它自己却无能为力。早在2015年11月安倍与奥巴马在会谈时就曾表示：“将在认真判断（南海）局势对日本安全环境的影响的同时，研究巡航南海问题。”尽管2015年11月底日本的舆论调查表明，52.7%的被调查者支持巡航南海（反对者仅为39.9%），但安倍仍无法应允，实在是因为日本目前心有余而力不足。一方面海上自卫队在东海方向上要密切关注中国的动向，同时还要防范朝鲜的核导发射，另外还要在亚丁湾海域护航，根本没有多余的舰艇巡航南海。
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