廖文毅等人在中国领土毫无立足之地，跑到香港、东京等地鼓吹台湾独立。但其不足百人，无实际武装斗争经验，一味幻想美国出兵。美国政府深知不能把宝押在他们身上。
由于台湾易守难攻，中共没有海空军，短期内难以对台湾构成威胁。但要想从台湾反攻大陆也绝非易事，蒋介石指望国民党军队能够在华南或西南地区抵挡一段时间，扭转危局。但是，国民党残兵败将一触即溃，望风而逃。10月15日，解放军攻占广州。11月30日，攻占重庆。12月8日，“国民政府”迁往台湾。
解放台湾错失良机
蒋介石下野后，毛泽东判断蒋介石很可能退往台湾或西南地区。1949年3月15日，新华社发表社论，宣示“中国人民一定要解放台湾、海南岛和属于中国的最后一寸土地”。解放军跨过长江，周恩来派黄华等人在南京、上海与司徒雷登秘密接触，要求美国停止支持蒋介石撤往台湾，不再给台湾军事援助。美方表示不会派兵帮蒋介石防守台湾。
为防止蒋介石“建都重庆，割据西南”，毛泽东下令二野、三野、四野乘胜追击，消灭国民党的有生力量。三野挺进江浙，直逼福建。由于毛泽东长期在内陆从事革命斗争，虽曾想到进军台湾，但并未把攻克台湾作为战略重心，何况攻台确有现实困难，拟于1950年夏，消灭大陆国民党军队后再发动台湾战役。毛泽东于10月1日宣告中华人民共和国成立，承接“中华民国”的领土与主权。
解放军乘胜追击。10月，叶飞兵团解放福建大部地区，攻占厦门岛。25日，解放军1万人进攻金门岛，遭到胡琏兵团的拚死抵抗，全军覆没，为解放战争以来最大的一次失败。11月初，解放军在进攻浙东的登步岛时，也遭到了失利。毛泽东闻讯十分焦虑，停止进攻东南沿海诸岛，要求各部队总结经验教训。
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