张京育分析说，从目前海峡两岸领导人所宣示的原则来看，大陆方面强调互信的基础是一个中国原则或是一个中国框架，并希望双方能透过政治对话来探讨“国家尚未统一前特殊情况下两岸政治关系合情合理”。台湾方面则强调正视现实，亦即九二共识，一中各表，两岸主权重迭，治权互不隶属的政治现实。正视并尊重现实，双方的交流、合作、协商才有坚实的基础。两岸领导人应通过适当的管道，加强沟通，就这些比较空乏，抽象的概念准则，装填比较具体，可操作的内容，以便形成互信基础的共识，消除或减少彼此的歧见。
此外，张京育建议，除了长程，终极互信建立的探讨外，中程互信亦即保障两岸和平交流，和平合作阶段的“和平协议”，亦应提上探讨的日程。和平协议的研商与签署就是一项巩固和平，累积互信的基础工程。和平协议的达成与实践必能增进双方政治互信的效果。
他说，在和平协议未达成前，双方应考量军事安全互信协议。至少在冲突防止与冲突管控两方面要未雨绸缪。像海峡中线的概念，军事演习事先通报，船舶碰撞和其他意外事件的处理，热线沟通、军方人员互动等，都是可以进一步探讨的课题。避免战略与战术的误判，促进台海和平的共识，必能收增进两岸政治互信的效果。
在具体施政上，我们不要忘掉“外交是内政的延长”这一概念的启示，也就是海峡两岸内部的施政作为，非仅直接作用于各自内部的人民，也影响海峡另一方人民的是非、价值和利害判断，最终对两岸互信产生正面或负面的影响。例如台湾方面过去曾采取过的一些去中国化的教育、文化政策；“正名”、“制宪”等政治举措都严重损害、冲击两岸关系，动摇两岸互信。大陆方面对宪政、民主、人权、法治兼顾下处理维护问题，如何对待言论自由、新闻自由、学术自由、人民的知情权，如何看待异议分子、基本人权与环境保护的倡导着，都深受台湾地区人民和海外华人的注目，也会涉及到他们对大陆执政者和政治体制的评价和信任度。
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