卜睿哲认为蔡政府的两岸政策是“低调、谨慎而自律”。他表示，部分人认为两岸僵局肇因于蔡英文拒绝接受“九二共识”以及中共所要求的“核心内涵”。但他认为，蔡英文其实已经明确表达了在这些议题上的立场，只是面对岛内政治分歧的局势，选择以模糊的方式回应。卜睿哲说，蔡英文就职后曾有机会能建立一个对等、具建设性、且相称的两岸互信机制，但是中共从根本上就拒绝承认民进党法理的存在，甚至不愿与蔡政府在同一平台上进行沟通，使此机会付之阙如。
卜睿哲强调，除非蔡英文愿意清楚、不含糊地承认“九二共识”及其一中核心内涵，否则蔡习会是不可能发生的。
卜睿哲认为台湾应该思考三个问题：第一，如果中国决定不再透过岛内统派政治势力来推行两岸统一，而改与台湾人民直接对接，那台湾该如何调整自己的大陆政策？如果中国对台武吓持续升高，台湾又该如何因应？第二，考量到“国安”与战略利益，台湾是否该在美猪、美牛与军武等政策上有所让步？第三，台湾社会目前处于两极化的政治环境，许多重大法案的推动因阵营间互相杯葛而窒碍难行，政治领袖是否该寻求朝野共识，避免空转内耗。
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