二零零三年十一月二十七日，“立法院”二百一十名“立委”集中表决多个《公民投票法》草案。其中扁政府“行政院”版”及“蔡同荣版”的“公投法”法案，因为当时民进党“立委”只有八十人，均势不力敌，遭到占有议席优势的国民党党团和亲民党党团联盟的合力狙击，而被否决，国亲联盟还讽刺民进党不敢支持“统独公投”。随后，在野党国亲联盟出于逆向思考和行动，充分利用占议席多数的优势，实行“以公投遏止公投”，通过了在“行政院”版”基础上，对关键条文加以多重限制的《公民投票法》草案，规定“公投”能复决法律、立法原则、重大政策、“宪法”修正案，“公投”也能创制立法原则或重大政策，但不得创制“宪法”。而且，将发动“公投”连署，及投票通过“公投案”的“门槛”，都标得很高，不但是难以发动，而且即使是得以发动，也将难以通过，因而被民进党攻击为“鸟笼公投”。
而吊诡的是，通过的条文采纳了民进党版的“防御性公投”条文，这是表决时泛绿主张删除、泛蓝却主张保留的条文。面对“蔡同荣版”的“国土范围”等改变“主权现状公投”相关条文，民进党党团被迫以“间接封杀”方式全部投下弃权票，蔡同荣也投了弃权票，“新潮流系“立委”李文忠则投了全场唯一的反对票，表决结果：出席一百九十人，赞成十四人、反对一人、弃权一百七十五人，“蔡同荣版”草案惨遭封杀。台联党党团成员马上头绑紫色布条，抗议“鸟笼公投”。民进党党团则表示“深感遗憾”，不少人甚至大骂国亲联盟版是虚晃一招、完全失去“公投”真义，“台湾人没有尊严啦！”蔡同荣则说，他的版本只获得十四张赞成票︰“民进党正式拿牌子说弃权，最后只有十四票赞成。民进党攻击人家（国亲联盟版）是‘鸟笼公投’；但人家现在要让你投票，现在鸟笼门打开了，你又不飞出去。”
尽管民进党极为不满由国亲联盟主导通过的《公民投票法》草案，但按照法律规定，陈水扁必须签署颁布。二零零三年十二月三十一日，陈水扁签字公布《公民投票法》，全文六十四条，自公布日施行（依《中央法规标准法》规定，《公民投票法》于二零零四年一月二日生效）。陈水扁签字时，蔡同荣等人在旁见证，陈水扁将他签字用的笔送给蔡同荣，以表彰他长期以来推动“公投立法”的“功勋”。只不过是，陈水扁所签署颁布的《公民投票法》，并非是陈水扁本人及民进党所喜欢的。 |
