此前，杨效曾对于如何从海量NGS数据中准确鉴定植物miRNA进行了系统研究并开发出了效果显着的方法——miRDP系列工具（miRDeep－P和miRDeep－P2），该系列方法已经成为国际上鉴定和分析植物miRNA的标准方法。2018年底，杨效曾又对原有方法进行了系统升级，升级后的新方法在解析大基因组和复杂基因组植物（如小麦）的miRNA鉴定和注释方面得到了全面提升，在提高预测敏感度和精度的同时，极大地降低了运算时间，优势显着，该系列相关成果曾发表在国际生物信息学的顶级杂志《Bioinformatics》上。在杨效曾的带领下，国内外团队还对玉米根虫中的miRNA进行了系统的挖掘和鉴定，并比较了动物中尤其是昆虫中miRNA的演化，该工作为利用miRNA作为RNA干扰的载体开发新抗虫技术奠定了基础，相关成果已经被基因组学的顶级杂志《Genomics， Proteomics ＆ Bioinformatics》接收。
（来源：科技日报） |
