文章认为，实施跨地区横向生态补偿，还要与生态系统服务、生态产品交易、生态保护的发展机会成本等情况相适应，建立健全长效机制。
一是结合国土空间规划，以“生态—经济”紧密联系为重要依据，划定以流域、生态功能区、城市群等为对象的跨地区生态补偿区。各生态补偿区设立跨地区的综合生态补偿机构，审核审定生态补偿标准，审议各地区生态贡献，促进地区之间沟通协调，引导生态受益地区通过资金补助、产业转移、人才培训、共建园区等方式对保护地区实施补偿。
二是与实施主体功能区规划、国土空间规划相结合，厘清地区之间的生态关系。构建生态贡献评价指标体系，科学界定各地区保护者与受益者的权利和义务，设置地区“生态财政”库，对于森林、草原、湿地、荒漠、海洋、水流、耕地等方面的各项指标制定统一标准，并统一监测方法、监测时间等，予以年度公报和年度考核，建立生态保护补偿标准体系。
三是扩大跨地区横向生态补偿范围。中国已将森林、草原、湿地、荒漠、海洋、水流、耕地等纳入生态补偿重点任务领域，将各类禁止开发区域、重要生态屏障等作为完善补偿机制的重点生态区域，提出在长江、黄河等典型流域和在京津冀水源涵养区等开展跨地区生态保护补偿试点。在大力推进生态文明建设中，可考虑在推进国土空间规划的同时，鼓励各生态补偿区内进行地区之间的协商沟通，健全资源开发补偿制度、碳排放权抵消机制等，开展跨地区生态补偿，建立地区之间的绿色利益分享机制，实现区域生态共建共享。
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