灾后，日本自卫队开始对这一体制进行反思，进而酝酿调整变革，提出破除防卫力量部署按地域条块分割的固有定式，确立了根据需要从全国调配作战力量的指导思想。
2013年，日本防卫省在修订后的《中期防卫力量建设计划（2014-2018）》中明确提出，“新编陆上总队，废止中央快反集团，将其所属部队并入陆上总队。”因而也就有了今年3月27日成立陆上总队这一重大体制调整。
随着陆上总队的组建，日本自卫队实现了对陆上防卫力量的一元化指挥和协调。自卫队的联合作战指挥体制在顶层上也实现了扁平化和集权化，形成了统合幕僚长面对陆上总队司令官、联合舰队司令官和航空总队司令官的指挥格局。那么，既然已经补上了陆上自卫队指挥机构缺失这一环，自卫队再提出组建“统合司令部”是否显得多此一举呢？
事实上并没有这么简单。日本自卫队自成立起，一些自卫队高级官员和政客就开始谋求突破“文官统领”的原则。早在1978年，自卫队统合幕僚会议议长栗栖弘臣就在一次公开发言中声称，“《自卫队法》中关于自卫队只有在首相发出指令后才能行动的条款是有缺陷的，一旦祖国遭到突然袭击，一线部队指挥官有权采取超法规的特别措施予以应对”，公开质疑“文官统领”制度，要求赋予自卫队更大的指挥权和自主权。
安倍上台以来，一直在努力推动修改《自卫队法》，为自卫队更多地走向前台走出海外，获得更大的指挥权和决策权，建立“正常化军事领导体制”奠基铺路。“文官统领”制度和“专守防卫”政策作为日本自卫队的建设之本，想要实现突破从来都不是一件容易的事，需要谨慎考量民意和各种政治环境，搞不好政府也要下台，因而往往采取了虚与委蛇的方式渐进推进。所以，日本在做出某个重大军事动作的时候，总是要渲染“周边危急时态”，以获得各界的支持。
即便是在极力推动修改宪法第九条的安倍政府，也是通过组建“国家安全保障会议”、通过新安保法、以“防卫装备转移三原则”取代“武器出口三原则”等一系列动作，对日本的防卫决策机制、法律基础和武器出口进行渐进式的改革和调整。所以，日本自卫队2010年以来发展目标的变化，从“机动防卫”到“综合机动防卫力量”再到新近提出的“跨域防卫”，都是朝着建立一元化的联合作战指挥体制目标迈进的，在措辞上也是煞费心机。
这次防卫省提出筹建“统合司令部”，仍然把应对周边国家的导弹威胁和网络攻击等“紧急事态”作为重要理由。其实，早在两年多前，自卫队统合幕僚监部就已将建立“统合任务部队”和“统合司令部”提上了议事日程，并拟定了详尽的方案。
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