上述档案中又以省档案馆、厦门市、武夷山市、福州市档案馆收藏最多。除此之外，其它一些档案馆，如闽侯、长乐、莆田、永安、南平、建瓯、松溪、连城、上杭、福鼎、福安、寿宁等市县档案馆也不同程度地保存着一些涉台档案。
林真表示，福建各地档案馆所收藏的涉台档案文献较为丰富。从文件种类看，主要为训令、指令、公函、电报、代电、呈文、批文、各类报表、名册、书刊等等，多数官方公文；从内容方面看，涉及政治、经济、社会、文化、教育等与台湾相关问题与事情，主要有三个方面的内容：一是有关台民的档案，二是台胞抗日复台档案，三是闽台经济文化关系档案。
林真认为，馆藏涉台档案具有重要的价值。福建省各级档案馆馆藏涉台档案内容十分丰富，涉及政治、经济、社会、文教各个方面，上述档案及其整理开发对促进和深化日据时期台湾史和闽台关系史的研究有着重要的参考价值和意义。
林真也指出，馆藏涉台档案在时间和内容上均有较大的不足。
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