两岸南海合作，需要两岸统一认识，建立相当程度的互信，进行充分的交流与沟通，把握两岸南海合作的正反两方面条件，以期搭建形成相当成熟的官方交流管道与平台，才能有所实质性作为。正如“立法委员”林郁方所说，“目前来讲，两岸合作会引起周边国家的疑虑。我想两岸看南海问题，需要一个长远的战略观。如果我们进行合作，容易被解读为以合作对抗其他国家，我认为这对大陆、对台湾都不是好事情。现阶段我认为只能做到保持一种默契，就是彼此不要对对方所占领的岛屿采取敌对的行动。”
台湾缺少油源，台湾中油与大陆的中海油合作，民进党或国民党政府均同意在东沙岛北边海域的南海北坡做油气探勘、开发。大陆的深海钻探平台在南海该海域开启作业，对欠缺技术的台湾中油、两岸能源合作是新的契机。大陆方面耗资60亿人民币的深水钻探平台“海洋石油981”，于2012年4月9日在南海打下第一口井。“国安局长”蔡得胜证实台湾中油在太平岛附近有一个油井独立开发计划，到目前为止没有遭到周边国家的干扰或阻止。
国际因素影响两岸海洋事务合作
对大陆而言，两岸在南海等海洋事务上的合作有广泛的诉求空间；相对而言，台湾承受三层次博弈，包括台湾内政层次、两岸层次以及国际层次，其中国际层次又涉及台湾对东南亚的政策以及对美日的战略前导。
根据马英九在竞选“总统”时的政见显示，“重建台美互信，巩固双边关系”、“支持美日安保，改善台日关系”以及“敦亲睦邻，拓展亚太关系”，其中包括一方面促请美方继续落实“台湾关系法”及“六项保证”；另一方面，我们身为“负责任的利害关系者”，也有决心承担自身防务，购买必要的防卫性武器；支持“美日安保”做为维护东亚安全的重要机制；以及希望将来能分别签订《自由贸易协定》，最后达成“东盟10＋3＋1”的目标。 |
