事实上，李咏怡的反中立场鲜明，2019年12月，她撰写的“统战、侍从主义与间接统治：理论化香港‘联络处’的角色”（United Front，Clientelism，and Indirect Rule：Theorizing the role of the“Liaison Office”in Hong Kong），这篇所谓论文污蔑内地，抹黑中央，其论调引发社会不满。
“评审委员是个小圈子”
不过，本身对国家、特区政府有强烈对抗意识的李咏怡，却晋身研资局人文学及社会科学学科小组辖下的“优配研究金及其他个人研究资助计划”的评审小组做委员；而李亦成功获小组直属的“人文学及社会科学学科”批出50万8000多元的研究基金做学术研究。李咏怡未做评审员之前，已多次获批研究基金，包括2005年1月的29万9000多元、2009年39万5000多元、2012年59万7000多元。
作为接受研资局研究基金资助的“常客”，李咏怡早在10年前就“关注”研资局的拨款权。2012年中央政策组向研资局收回2000万元“公共政策研究计划”的拨款权，李咏怡与郑宇硕、关信基、陈家洛、冯伟华等24名高教界反对派选委发起联署抗议，并召开记者会向时任中央政策组首席顾问邵善波施压，一众反对派称影响拨款机制的透明度、利益输送、把政策研究科学变成政府政策宣传工具云云，搞得好像被打压一样，引来西方关注及支持。
曾出任研资局评审委员的陈文鸿指出：“评审委员的教授都是小圈子，虽然理论上申请人不知评审项目的专家身份，但学术圈子细，实际上要知道并不难。”
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