实际上，这两个基金会都是“国安局”的外围智库，经常受“国安局”委托进行相关政策研究。因而其财政状况相当充裕，既有受薪的董座，也有实位专职的研究员。而且两个基金会都是在台北市汀州路的同一栋豪华大楼内办公，两个牌子更是并列装置。但这两个基金会有具体分工，亚太基金会主力两岸关系，而远景基金会虽然挂着“两岸交流”的招牌，但其主要业务却是调研国际关系，尤其是台湾与美国、日本的关系。
马英九在其八年任期内，十分重视这两个基金会，因而不避嫌，两个基金会的董事长都交给他的大陆和“外交”政策头号顾问赵春山出任。这是较为罕见，因而赵春山也不辱使命，为马英九两岸关系政策的推动，及谋划实施“活路外交”，东奔西走，多次前往大陆洽商，据说还曾获安排见到了很高层次的领导人。而在新加坡举行的“习马会”，赵春山还一直参与谋划幕僚工作，因而成为与马英九同乘一架专机前往新加坡的几名学者之一。正因为如此，蔡英文上台后，虽然剥夺了赵春山两个基金会董事长的职务，但仍然聘请他为亚太基金会的首席顾问。但由于蔡英文拒绝承认“九二共识”，因而就无所作为。
亚太和平研究基金会成立于一九九四年，前身为“中华欧亚基金会”，蔡英文上台后改名为亚太和平研究基金会，是一个具有浓厚官方色彩的所谓“民间”但实质上是由“国安局”出资的外围智库，打着“超越党派、政策导向、战略视野”的口号，主要研究领域为台湾海峡两岸关系、中国大陆研究与国际关系，除曾受陆委会委托承办“和平论坛”外，还曾经举办“美台中关系变数与展望”国际研讨会、“台日论坛”等公开活动。其下设六个研究组，包括大陆政治、大陆经济、大陆社会、大陆外交、大陆军事及两岸关系。 |
