第二，台湾可以参与更多的功能性地区合作机制。
例如，中国大陆的湄公河流域开发项目，当前重点之一是加强邻国的基础设施建设（互联互通），即包括公路、铁路、港口（航空港、海港等）、通讯电信等，台湾的企业也可以参与。湄公河流域合作计划具有多国别、多领域、多层次的特点，台湾也有巨大的优势可以参与。亚洲开发银行对上述项目有较大的资金支持，台湾早就是亚洲开发银行的重要成员，借助于此可发挥一定的作用。
中国大陆与东盟国家的合作领域广泛，如能源、气候环境、粮食安全等等，台湾如能加入，则两岸可双赢，地区可多赢。由于官方参与的复杂性，两岸可以首先通过企业层面的合作参与，逐步进入具有官方性质的功能性地区合作。
第三，台湾的专家学者可参与地区合作智库合作平台。
在地区多种机制并存时，智库合作平台的作用愈显突出，专家学者既可交流思想观点，也可探讨途径方案，为决策者建言献策，对社会传布理念。近年来，两岸专家已经越来越多地在共同的平台上合作协力。由于不同的智库平台具有不同的性质，有的是纯民间的，有的是被地区组织所指定的，有的担负着特定的二轨或一轨半功能，台湾专家学者的进入途经也会有所不同，纯民间性组织可以自由加入，而后两者则需作出特殊安排。在特殊安排之前，最快捷的途径即台湾专家以大陆大学或智库的客座教授、客座研究员（事实上很多台湾专家确实具有此身份）加入。
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