中共等同中国，台湾基于反中共，然后反中国，认同从此开始发生剧烈的切断。民意调查显示，在千岛湖事件之后，整个认同问题进入黄金交叉阶段，台湾社会认同往而不返，台湾认同逐渐取代中国意识。在李登辉进入他最后一个任期之后，开始在教育上头推动“认识台湾”。（王晓波：有三本，分为认识台湾历史、认识台湾地理、认识台湾社会）在推动之初还不是正式的课程，但“教育部”强力要求学校教授；随后一路下来，扁政府完全继承，而且写入历史课纲，变成教科书，要上课、考试，于是这个过程逐渐塑造成基本的“国民意识”。
现在台湾30岁以下的年轻人，基本上对两岸的认知就是“一边一国”。那么台湾这边叫做“台湾国”还是“中华民国”？从元旦升旗典礼、街头上围国旗围巾，我们可以知道“中华民国国号”目前占优势地位，但问题是，对照于“宪法”规范，这个“中华民国”已经完全异化，这绝对是一连串政治操弄的结果。
李登辉最后一个任期，“教育部”内有一个秘密的“本土教育推动小组”，这是当时“教育部长”偶然的情况下说溜了嘴透露的，据说当时领导此秘密小组的就是杜正胜。后来，杜正胜从幕后走向台前，而且用横眉冷对千夫指的方式在台横扫千军，不管有多少争议，他很彻底地推动了他的想法。举例来说，以“教育部”惯例，是十年修改一次课纲，可是杜正胜可以为了推动本土教育，不依正常程序走，硬是先行推动暂纲（暂时课纲），以强力政治介入操作。
台湾历史教科书的问题
因此，现在台湾历史教科书最大的问题在于其结构，而不是个别用词、用语问题。在词汇方面，我们可以看出它尽可能采取中性用词方式来描绘，可以有一些闪躲的空间。但我们不应被词汇烟瘴所蔽，而要看透背后的结构性问题。结构性问题在于先教台湾史、再教中国史、世界史。
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